源流一
源于姬姓，出自春秋时期晋国献侯四世孙奚的封地，属于以封邑名称为氏。据史籍《元和氏纂》和《辞源》记载，春秋时期晋献侯的第四世孙奚，时为晋国大夫，受赐食邑于祁（今山西祁县古镇），以邑为氏，称祁奚。祁奚，字黄羊，晋国大夫。史籍记载，周简王姬夷二年（晋厉公姬寿曼十年，公元前570年），“祁奚请老”，可知时年祁奚至少在五十岁以上。其生年最晚也在晋灵公姬夷皋初年（公元前 620年）。祁奚“历事晋景、厉、悼、平四世（公元前599～前532年）”。那么，既便从晋平公姬彪继位初年（公元前 557年）算起，其享年应在六十岁以上。如果以晋平公卒年计，则可能有八十余岁，可谓长寿。在祁奚的后裔子孙中，多以先祖封邑名称为姓氏，称祁氏。晋国祁氏一族还有许多分支，如祁成氏、祈夜氏、祈射氏等，后皆省文简化为单姓祁氏，世代相传至今，史称祁氏正宗。
祁氏族人大多尊奉祁奚为得姓始祖。
源流二
源于姬姓，出自黄帝分封的原始姓氏，属于帝王赐姓为氏。据史籍《广韵》记载，黄帝共生有二十五子，他给其中的十四个儿子分封了十二个姓氏，其中就有祁氏，是最古早的姓氏之一。
这十二个姓氏是：姬、姞、酉、祁、己、滕、箴、荀、任、僖、嬽、依，为百姓之祖一。
源流三
源于伊祁氏，出自远古尧帝的后代，属于以先祖名字为氏。据史籍《姓氏考略》记载，帝尧伊祁氏，亦称伊耆氏。
上古时期“祁”与“耆”二字通义，因此在帝尧的后裔子孙中，很早即有祁氏、耆氏，后皆统一为祁氏，是非常古早的姓氏之一。
源流四
源于陶唐氏，据史籍《路史》记载，少昊之后裔中有祁氏，属于以谥号为氏。祁，在两周时期为一种谥号称谓。在史籍《左传·庄六年》中记载：“邓祁侯。谥法，经典不易曰祁。”古人称死抱着经典之制不放的人和现象为“祁”。邓侯认为自己是楚文王的舅公，外甥焉有攻打舅舅之事？结果外甥还就真的把舅舅的国家灭了，堪称“祁”人也。因此，楚文王给邓侯上的谥号即为“祁”，史称邓祁侯，以警后世。
邓祁侯的后裔子孙和邓国故民，多有以先王之谥号为姓氏者，称祁氏，世代相传至今。
源流五
源于姬姓，出自周朝时期官吏祁父之后，属于以官职称谓为氏。祁父，是《周礼》军制中掌管军事典制之重臣，一说是管理兵甲的司马。在西周军制中，主政不主兵的军事统领，称祁父，这在《史记·谥法》中有明确注释：“治典不杀，曰祁。”后世的历朝历代，将犯了重罪后而不判处死刑的罪
